临床医学论文_MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料来源
1.2 仪器与试剂
1.3 方法
1.3.1 分生孢子悬液制备
1.3.2 菌株培养
1.3.3 菌落前处理方法
1.3.4 构建参考库
1.3.5 结果判读
1.3.6 验证并创建超级谱图库
1.4 统计学处理
2 结 果
2.1 不同培养天数、培养温度及前处理条件对TM质谱谱图的影响
2.2 MALDI-TOF MS对不同培养温度、培养天数的TM的鉴定正确率比较
2.3 MALDI-TOF MS对不同前处理方法培养的TM的鉴定正确率比较
2.4 MALDI-TOF MS在不典型TM鉴定中的价值
2.4.1 不典型TM的形态学特征
2.4.2 TM自建数据库在不典型菌株鉴定中的应用
3 讨 论
文章摘要:目的构建用于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)鉴定马尔尼菲篮状菌的数据库,并探索用于MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌的最佳培养条件和前处理方法。方法利用8株马尔尼菲篮状菌构建自建数据库,比较不同培养基[沙保弱葡萄糖琼脂培养基(SDA)、沙氏葡萄糖肉汤培养基(SDB)]、培养温度(28、35℃)、培养天数、前处理方法(甲酸乙腈法、直涂法)对质谱谱图质量及鉴定正确率的影响。结果在VITEK MS科研模式(RUO模式)中成功构建马尔尼菲篮状菌质谱自建数据库。SDA较SDB更适合MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌,后者采集的质谱谱图中干扰峰较多。两种温度培养采集的质谱谱图的特征峰相似,但35℃菌落的鉴定正确率略高。培养3~5 d时的菌落鉴定正确率均高于71.4%,其中培养5 d时鉴定正确率最高,可达100.0%。甲酸乙腈法的提取效果优于直涂法。结论马尔尼菲篮状菌在SDA上35℃培养3~5 d,并使用甲酸乙腈法进行前处理可得到最佳的鉴定正确率。这对于形态不典型的马尔尼菲篮状菌同样适用。
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